만성피로 증후군은 현존하는 질병 가운데 애매모호하고, 논쟁의 여지가 있는 질환의 하나다. 이 질환이 인식되고, 명명된 후 15년 이상이 지난 현재까지도 병의 원인에 대해서 전문인들 간에 논의의 대상이 되고 있다. 즉 CFS의 원인이 바이러스성 감염증인지, 혈압의 이상인지, 만성 감염증인지, 식품 알레르기인지, 화학물질에 대한 민감성인지에 대해서 어떤 증상이 진짜인지조차 의심하고 있다. 그럼에도 불구하고 CFS는 지속적이고, 압도적인 피로, 인후통, 미열, 임파절 종창, 두통, 근육 및 관절통, 장 불쾌감, 감정 장해, 우울증 그리고 집중력 장해를 포함하는 다양한 증상의 복합으로 나타나는 새롭게 정의가 내려진 증후군이다. 이와 같은 증상들이 수년간에 걸쳐서 나타났다가 사라지기도 한다. 만일 심한 피로가 2주일 이상 동안 지속되거나 또는 CFS로 의심되는 어떤 이유라도 있으면 스스로 진단하지 말고 의사와 상담을 통하여 기타 가능한 질환을 배제하여야 한다. 일단 다른 질환이 제외되면 자연요법을 사용함으로써 회복의 기회를 얻을 수가 있다.

CFS는 여러 인자의 복합으로 야기되어 종종 면역시스템의 저하로 이어진다고 여겨진다. 물론 치료의 열쇠는 많은 인자와 연관이 될 수 있는 면역시스템의 불균형의 원인을 찾아내는데 있다. 예를 들면 어떤 사람들의 경우
에는EBV(Epstein-BarVirus), CMV(Cytomegalovirus), 기록 HHV-6(Human Herpes Virus)와 같은 바이러스의 만성 감염증이 중요한 역할을 하는 것으로 생각되고 있다. 실제 CFS 환자에서 다양한 면역시스템의 이상이 보고되고 있다.

이 가운데 가장 일관되게 나타나는 이상은 NK 세포의 수와 활성의 저하다. 따라서 CFS는 NK 세포저하 증후군(Low Natural Killer Cell Syndrome : LNKS)이라고 언급되기도 한다.

또한 마이코플라즈마(Mycoplasma) 그리고 클라미디아(Chlamydia)와 같은 타 감염증도 의심되고 있다. 또한 칸디다의 과잉증식도 CFS 환자의 공통의 문제점으로 보여지기도 한다. 면역시스템이 장해를 받으면 감염증은 오래가고, 피로는 지속된다. 감염증시에 피로가 나타나는 이유는 면역시스템은 인체가 안정시에 최고로 유지되기 때문에 피로가 감염증에 대한 인체의 반응기전으로 작용한다.

또한 이 질환을 가진 사람들의 공통적인 소견은 호르몬 불균형(Hormone Imbalance)이다.

가장 빈번한 것으로는 부신샘부전(Adrenal Gland Insufficiency)으로써 부신소진(Adrenal Burnout)으로 언급되기도 한다. 부신샘은 스트레스 호르몬인 코티솔(Cortisol)과 “호르몬의 어머니(Mother Hormone)”의 역할을 하는 DHEA(Dehydro-epiandrosterone)를 생산한다.

이들 호르몬은 만성피로를 가진 사람에서는 통상 결핍되어 있다

. 따라서 이들 호르몬의 농도를 정상상태로 회복하면 전반적으로 큰 도움이 된다. 그리고 인체의 수많은 호르몬의 경우도 동일한 경향을 나타낸다. 갑상선 기능저하도 세포 내에 에너지의 생산이 최적 이하로 감소될 수 있기 때문에 핵심적인 문제가 될 수 있다. 더구나 테스토스테론 또는 성장 호르몬의 결핍증과 에스트로겐 및 프로제스테론의 결핍증과 불균형도 에너지의 저하를 가져온다.

호르몬 불균형의 대다수의 원인은 시상하부의 기능부전(Hypothalamic Dysfunction)일 수도 있다.

 이 경우는 뇌와 부신샘, 갑상선 및 타 호르몬 장기 간에 호르몬 및 신경 메시지의 불균형에 기인된다.

소화불량 및 해독기능 장해도 만성피로의 근본 원인으로 고려할 필요가 있다.

또한 식품 및 영양소의 흡수불량은 영양 부족증을 야기시킨다.

수은 및 살충제와 같은 환경적 독소는 에너지 생성에 필요한 효소기능을 억제시킨다. 건강에 나쁜 식이도 만성피로의 발판을 마련해 준다. 대량의 정제된 탄수화물은 혈당문제, 칸디다 과잉증식, 부신샘의 요구도 증가 그리고 만성 염증에 기여하고, 면역저하를 야기할 수 있다. 더구나 가공식품도 에너지 생성과 건강한 면역시스템에 필요한 영양소가 결핍되어 있다.

그리고 인체에 대한 만성적인 스트레스의 작용도 아주 중요하다. 따라서 정신적, 감정적 그리고 영적인 스트레스를 효율적으로 관리를 하지 못하는 사람들은 피로의 고통을 더 많이 받는 경향이 있다. 이와 마찬가지로 불안증과 우울의 문제점을 해결하지 못한 경우도 피로가 증가된다.

운동은 건강유지의 근본적인 열쇠다. 운동이 부족하면 피로가 증가하고, 반면에 과도한 훈련 및 과다운동은 에너지 생성에 관여하는 장기의 장해를 가져온다. 또한 수면도 중요한 역할을 한다. 수면은 인체를 회복시키고, 재생시키는 방법이다. 따라서 적당한 수면은 필수적이다.

결국 CFS의 근저에 있는 “핵심 결손(Core Defect)”은 모든 세포에서 발견되는 미토콘드리아(Mitochondria)의 에너지 공장의 결함이다. 미토콘드리아는 세포 내에 있는 극히 미세한 캡슐 모양의 구조(Capsule-like Structure)를 가지고 있으며, ATP의 화학적 형태로 에너지를 생산하여 인체의 모든 기관에 파워를 부여하고 있다. 만일 미토콘드리아가 비효율적으로 기능을 수행하면 최적 에너지 양의 ATP를 1/9만 생산하게 된다. 따라서 CFS를 극복할 수 있는 하나의 방법은 미토콘드리아가 에너지를 더 많이 생산할 수 있게끔 에너지의 원료물질을 공급하면 도움이 될 수 있다.